Standardisation of plant–pollinator interaction data under FAIR principles: experience from Pampean agroecosystems

A bee (Melissodes tintinnans) visiting sunflower. 
Photo by Marina Chamer.

by Gonzalez-Vaquero et al.

Plant–pollinator interactions are essential to the functioning of natural and agricultural ecosystems. Although the volume of available data on these interactions is steadily increasing, their utility for integrative studies is limited by heterogeneity in data formats and poor documentation. The WorldFAIR project (https://worldfair-project.eu/) aimed to improve data interoperability and promote the adoption of the FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) principles. In this study, we evaluated the effectiveness of two standardisation approaches (manual and semi-automated) applied to five datasets with varying levels of cleanliness, complexity, and structure. Our results show that for small datasets (fewer than 637 records), the manual method is more suitable, while for larger datasets, the semi-automated approach—based on tools such as OpenRefine—is more efficient after an initial learning curve. Additionally, we compiled a list of common issues encountered during the standardisation process and suggested possible solutions. This study aims to guide those interested in applying FAIR principles to ecological interaction data, supporting the planning and decision-making process when choosing the most suitable approach.

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Spanish version

Las interacciones planta-polinizador son esenciales para el funcionamiento de los ecosistemas naturales y agrícolas. Aunque existe un volumen creciente de datos sobre estas interacciones, su utilidad para estudios integradores está limitada por la heterogeneidad de formatos y la escasa documentación. El proyecto WorldFAIR busca mejorar la interoperabilidad de los datos y fomentar la adopción de los principios FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable). En este trabajo evaluamos la eficacia de dos métodos de estandarización (manual y semiautomático) aplicados a cinco conjuntos de datos con distintos niveles de limpieza, complejidad y estructura. Nuestros resultados muestran que, para volúmenes pequeños (menos de 637 registros), el método manual es más conveniente, mientras que, para conjuntos más grandes, el método semiautomático, basado en herramientas como OpenRefine, resulta más eficiente tras una curva inicial de aprendizaje. Además, elaboramos una lista de problemas comunes durante el proceso de estandarización y sugerimos posibles soluciones. Este estudio busca orientar a quienes deseen aplicar los principios FAIR en estudios de interacciones ecológicas, facilitando la planificación y toma de decisiones sobre el enfoque más adecuado.

FIT for purpose? Sampling Bees in Flowering Canopies with Flight Interception Traps (FITs)

by Krahner et al.

Many tree species provide important food resources for pollinators, but bees are rarely sampled from canopies. This is because canopies are often difficult to access, and because there is a lack of knowledge about appropriate sampling methods.

We assessed the suitability of flight interception traps (FITs) for sampling bees from flowering canopies. These traps catch insects by interrupting their flight and are traditionally used for collecting beetles in forests. We compared bee communities sampled in different tree species (willow, apple, black locust, linden) between March and June 2024.

In total, we collected 395 bee individuals. In willow trees, we sampled more individuals of wild bees species than honeybees, whereas in linden trees and especially black locust, honeybees outnumbered wild bees. Bee individuals were only collected by the collection containers below the flight barrier, in contrast to the collection containers above the flight barrier. Our study includes a systematic review of previous studies that used FITs for sampling bees. It provides advice on best practices for future researchers seeking to sample pollinators in tree canopies.

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[German lay summary]

Obwohl viele Baumarten Bestäubern wertvolle Nahrungsressourcen bieten, werden Bienen nur selten in Baumkronen erfasst. Das liegt zum einen daran, dass der Kronenbereich in der Regel schwer zugänglich ist, zum anderen an einer Wissenslücke in Bezug auf geeignete Erfassungsmethoden.

Wir haben die Eignung von Lufteklektoren (Flight Interception Traps, FITs) für die Erfassung von Bienen in blühenden Baumkronen untersucht. Der Fangmechanismus dieser Fallen beruht auf einer jähen Unterbrechung des Insektenflugs. Traditionell werden Lufteklektoren für die Erfassung von Käfern in Waldbiotopen eingesetzt. Wir haben die Bienengemeinschaften untersucht, die in verschiedenen Baumarten (Weide, Apfel, Robinie, Linde) zwischen März und Juni 2024 mit Lufteklektoren erfasst wurden.

Insgesamt erfassten wir 395 Bienenindividuen. In Weiden wurden mehr Individuen von Wildbienen als von Honigbienen erfasst, wohingegen in Linden und insbesondere in Robinien die Individuenzahlen der Honigbienen im Vergleich zu den Wildbienen überwogen. Bienen wurden nur in den Fangbehältern unterhalb der Flugbarriere gesammelt, anders als in den Fangbehältern oberhalb der Flugbarriere. Unsere Arbeit umfasst eine systematische Übersicht früherer Arbeiten, die Lufteklektoren für die Bienenerfassung verwendet haben. Die Arbeit enthält methodische Empfehlungen für zukünftige Untersuchungen von Bestäubern in Baumkronen.